Genetické kmeny HIV-1 a HIV-2
Chapter 29 Genetics, Development and Inheritance 1 of 3 BI 233 Fall 2016 (Září 2024)
Jednou z hlavních překážek při léčbě nebo rozvoji účinné vakcíny proti HIV je vysoká genetická rozmanitost samotného viru. Zatímco viry, které používají dvojitou DNA pro replikaci, jsou poměrně stabilní, retrovirusy jako HIV se vracejí zpět ve svém replikačním cyklu (pomocí RNA s jedním kmenem) a jsou mnohem méně stabilní. Jako výsledek, HIV je vysoce náchylný k mutaci-mutovat, ve skutečnosti, asi miliónkrát častěji než buňky používající DNA.
Vzhledem k rozšíření genetické diverzity viru a přenosu různých virových podtypů z člověka na člověka může smíšený genetický materiál vytvořit nové hybridy HIV. Zatímco většina těchto hybridů umírá, nemnoho přežívajících často vykazuje větší odolnost proti terapii HIV a v některých případech rychlejší progresi onemocnění.
Variabilita HIV proto vytváří pro výzkumníky něco "pohyblivého cíle", přičemž nové rekombinantní (kombinované genetické) kmeny jsou schopné odolat nebo se zcela vyhnout neutralizačním činitelům. Někteří, stejně jako kmen A3 / 02, identifikovaní švédskými výzkumníky v roce 2013, dokáží vyčerpat imunitní obranu člověka mnohem agresivněji, než dříve známé kmeny.
Co jsou HIV-1 a HIV-2?
Existují dva typy HIV: HIV-1 a HIV-2. HIV-1 je považován za převládající typ, který představuje převážnou většinu infekcí na celém světě, zatímco HIV-2 je mnohem méně obyčejný a primárně soustředěný v západních a středoafrických oblastech. Zatímco oba tyto typy HIV mohou vést k AIDS, HIV-2 je mnohem obtížnější k přenosu a mnohem méně virulentní než HIV-1.
V rámci každého z těchto typů HIV existuje řada skupin, podtypů ("clades") a sub-podtypů. Nepochybně budou objeveny jiné podtypy a rekombinantní kmeny, protože celosvětové šíření HIV pokračuje.
HIV-1 skupin a podtypů
HIV-1 je rozdělen do čtyř skupin: skupina M (což znamená "hlavní"); Skupina O (což znamená "odlehlý", nebo za hranice, kde jsou vidět jiné skupiny); a skupina N (což znamená "non-M" a "non-O"); a skupina P (což znamená "čekající"). Čtyři různé skupiny jsou klasifikovány čtyřmi různými opičími imunodeficienčními viry (SIV), o kterých bylo známo, že jsou předávány lidem z opic nebo šimpanzům člověku.
Skupina HIV-1 M
HIV-1 skupina M byla první skupina, která byla identifikována a dnes představuje asi 90% případů HIV na celém světě a lze ji najít prakticky v každé části planety. V rámci této skupiny je 10 subtypů, které mohou být rozvrstěny mimo jiné jejich geografickým rozložením a jejich dopadem na různé rizikové skupiny.
- Podtyp A: pozorován v západní Africe a postihuje především heterosexuály a injekční uživatele drog (IDU).
- Podtyp B: převládající podtyp v Evropě, Americe, Japonsku, Thajsku a Austrálii, představující téměř všechny infekce v Severní Americe a přibližně 80% všech v Evropě. Infekce se vyskytují více u mužů, kteří mají sex s muži (MSM) a IDU než heterosexuálové.
- Podtyp C: popisován jako nejvíce rozšířený podtyp HIV, který představuje 48% všech infekcí na celém světě, především heterosexuální a primárně v subsaharské Africe, Indii a částech Číny.
- Podtyp D: Izolovat hlavně ve východní a střední Africe.
- Podtyp E: podtyp pouze v rekombinantní formě s podtypem A.
- Podtyp F: mezi menšími procenty infekcí pozorovaných v zemích střední Afriky, Jižní Ameriky a Evropy.
- Podtyp G: mezi menšími procenty infekcí v některých částech Afriky a Evropy.
- Podtyp H: u menších procent infekcí pozorovaných ve střední Africe.
- Podtyp J: pozorovaný v severní, střední a západní Africe a Karibiku
- Podtyp K: omezený na Konžskou demokratickou republiku (DRC) a Kamerun.
Skupina HIV-1 O
HIV-1 skupina O byla objevena v roce 1990 a představuje pouze 1% infekcí po celém světě. Tato skupina HIV je izolována v Kamerunu a sousedních afrických zemích.
Skupina HIV-1 N
HIV-1 skupina N byla objevena v roce 1998 a opět se objevila pouze v Kamerunu s méně než 20 dosud zdokumentovanými případy.
Skupina HIV-1 P
HIV-1 Skupina P je vzácný typ HIV, který byl poprvé identifikován u ženy z Kamerunu v roce 2009. Může se lišit od jiných skupin HIV, jelikož jeho původ je spojen s formou SIV nacházející se v západních gorilách. Přestože klasifikace "P" měla v úmyslu vyvodit status "čekající" (tj. Čeká na potvrzení další infekce), v roce 2011 byl identifikován druhý zdokumentovaný případ u kamerunského muže.
HIV-2 skupin
Ačkoli byly případy HIV-2 identifikovány jinde, infekce jsou téměř výlučně pozorovány v Africe. V současné době existuje osm skupin HIV-2, ačkoli jediné podtypy A a B jsou považovány za epidemii. Předpokládá se, že HIV-2 překročil druhy z druhu SIV, který postihuje slané mangabeys opice přímo k lidem.
HIV-2 skupina A je převážně vidět v západní Africe, ačkoli mezinárodní cestování vedlo k malému počtu dokumentovaných případů v USA, Evropě, Brazílii a Indii. Naproti tomu skupina HIV-2 byla omezena na části západní Afriky.
- Podíl
- Flip
- E-mailem
- Text
- Prameny:
- Sharp, P. a Hahn, B. "Původy HIV a pandemie AIDS." Cold Springs přístavní perspektivy v medicíně. Září 2011; 1 (1): a006841.
- Palm A.; Esbjörnsson, J.; Månsson, F.; et al. "Rychlejší progrese k AIDS a úmrtí souvisejícím s AIDS u osob se serinincidenty infikovaných rekombinantním HIV-1 A3 / CRF02_AG ve srovnání s podtypem A3." Journal of Infectious Diseases. 1. března 2014; 209 (5): 721-728.
- Vallari, A.; Holzmayer, V.; Harris, B.; et al. "Potvrzení pozitivní skupiny HIV-1 skupiny P v Kamerunu." Journal of Virology. Únor 2011; 85 (3): 1403-1407.
- Abecasis, A.; Wensig, A.; Paraskevis, D.; et al. "Rozdělení subtypů HIV-1 a jeho demografické determinanty u nově diagnostikovaných pacientů v Evropě naznačují, že epidemie jsou vysoce rozdělená." Retrovirology. 14. ledna 2013; 10: 7; dva: 10.1186 / 1742-4690-10-7.
Jak číst zprávy o genetické rezistenci proti HIV
Testy genetické rezistence na HIV identifikují mutace spojené se současnou nebo vyvíjející se rezistencí na léky. Zde se dozvíte, jak číst výsledky.
Odolnost proti HIV a testování genetické rezistence
HIV rezistence na léky je definována jako mutace genetické struktury HIV, která může způsobit určité viry částečnou nebo úplnou rezistenci vůči HIV léčivům.
Zpětné kmeny a jejich příčiny
Co je zpětné namáhání? Zjistěte základy této příčiny bolesti dolních končetin a typických možností léčby.